校徽代表的是一所學校持久奮鬥的精神和崇高的教育理念。
本校校徽設計於日據時代，主體由三片脈理分明的綠色香蕉葉片交疊而成。在葉片交疊處正中間，以白色襯托鮮紅的「南湖」二字，色澤鮮明，圖案結構勻稱有力。
早年，香蕉為南湖地區之特產。以鮮綠的香蕉葉交疊成校徽，說明了學校與地方打成一片，學校教育是以培養農業人才為目的；同時，象徵著校園永遠欣欣向榮，人才輩出，充滿蓬勃的活力。
